次世代シーケンス支援サービス

　次世代シーケンスは様々な目的に大変有用ですが、技術やコストの面から新規には始めづらい面もあります。
　分子医学部門では次世代シーケンスに不慣れな研究者の方でも、円滑に実験を始められるようサポートを
　行ってます。次世代シーケンスを用いた研究をお考えの方はご相談下さい。


【サービス内容】
　次世代シーケンスのライブラリー調製、機器の操作、二次解析等のサポートを行います。
　次世代シーケンサーを用いた研究をお考えの方は、分子医学部門（6191）までご連絡下さい。

　■サポートの詳細はこちらの【MiSeq導入説明資料.docx】をご覧下さい。
　■二次解析(データ解析)サポートについて
　　次世代シーケンサーで得られたシーケンスデータの解析サポートを行います。（公開シーケンスデータの再解析も可）
　　＜解析ソフトウェア＞
　　・CLC Genomics Workbench Premium（QIAGEN社製）
　　　次世代シークエンサーから出力される膨大なデータ解析に対応した統合配列解析ソフトウェア。
　　　リシークエンシング解析、トランスクリプトミクス解析、微生物メタゲノム解析、シングルセル解析等に対応
　　　　　ソフトウェアの詳細についてはこちらのメーカーのカタログをご覧下さい。
　　・Verseq（Golden Helix社製）
　　　臨床検体の遺伝子変異データのデータ解析に用いるクリニカルシークエンス解析ソフトウェア。
　 　　　　　ソフトウェアの主な機能についてはこちらをご覧下さい。
　　・R/RStudio（準備中）
　　　R言語を使用した解析が可能。解析用ツールなどの詳細については、別途お問い合わせください。
　■サービスご利用の際は、ご希望の内容に応じた申込書を記入して頂きます。
　　初めての方は、まず担当職員にご相談下さい。

　　・全面的にサポートを受けたい方は　　　　　　　　　　　　→　【NGS研究計画書.docx】
　　・ライブラリー調製のサポートを受けたい方は　　　　　　　→　【NGSライブラリー調製支援依頼書.docx】
　　・NGSで出力されたデータの解析のサポートを受けたい方は　→　【NGSデータ解析支援依頼書.docx】

【連絡先】
　内線：6191
　担当：

【次世代シーケンサーMiSeqで解析可能なアプリケーション】
　MiSeqは1解析で取得可能なデータ量が少なく設計されており、アプリケーションによっては一度に解析できる
　サンプル数が少なかったり、解析ができないものが存在します。以下の表を参考にして実験の計画を立てて下さい。

【次世代シーケンサー関連機器】