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【1】部門専任教員から 【2】お知らせ ●シングルセル解析 ライブラリ調製作業とデータ解析の受託分析・分析支援サービスのお知らせ ●シングルセル解析 & フローサイトメーターセミナー の資料をダウンロードいただけます(再掲) 【3】分子医学部門だよりの発行とメーリングリスト開設、登録のお願い |
【1】部門専任教員から |
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日頃より分子医学部門の活動へご理解とご協力をいただき誠にありがとうございます。 共用機器のRhapsodyによるシングルセル解析を行う方が増えてきました。当部門ではライブラリ調製とデータ解析の受託支援サービスを行なっております。共同利用のため購入した試薬キットも好評をいただき残り1回分になりましたので、利用をご希望の方はお早めにご相談ください。ご希望の方が多数の場合、今後も試薬の共同購入を行います。ご興味ある方はお気軽にご連絡ください。 (小代田) |
【2】お知らせ |
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●シングルセル解析 ライブラリ調製作業とデータ解析の受託分析・分析支援サービスのお知らせ分子医学部門ではシングルセル解析前処理システムBD Rhapsodyを使用するライブラリ調製作業、および、データ解析の受託分析・分析支援サービスを行っています。 シングルセル解析の試薬や必要な器具を揃えるのに初期費用が高い、サンプル調製方法がわからない、データ解析 の方法がわからない、などの理由で実験に支障を感じている方は是非当部門の受託分析支援サービスをご検討くだ さい。 Rhapsody 部門ホームページは こちら 利用の流れ 細胞の用意(利用者)→Rhapsodyを使用したライブラリ調製(部門担当)→シークエンス(利用者、外部受託分析) →データ解析(部門担当) 【ライブラリ調製】 機器:BD Rhapsody シングルセル解析システム (Rhapsody Express, Rhapsody Scanner) 場所:分子医学部門棟4階 406 シーケンサー室 【データ解析】 シングルセルRNAseqなどの次世代シーケンスデータを解析するための専用のPCとソフトウエアを使い、次世代シ ーケンスデータ解析を支援します。マップ後のデータの他、fastqファイルなど生データを読み込んで解析すること も可能です。公開データベース上のデータを使った解析も可能です。 詳細は部門ホームページをご覧の上、部門担当にご相談ください。 解析ソフトウエア:CLC Genomics Workbench (QIAGEN) 部門ホームページは こちら 【試薬共同利用分 残り一つです】 今年度共同利用のため購入した試薬キットが残り1回分となりました。利用をご希望の方はお早めにご相談ください。 シングルセル解析試薬キットのシングルセル解析を行う際に利用者が負担する初期費用をなるべく抑えるため、4回 分の試薬キットを分割して使用できるように部門で必要な試薬キット、器具類を購入しました。1キットは4回に分 けて別々に使用できるので利用者で日程を合わせる必要はなく、使用した分だけ費用を負担していただく形で利用 できます。本機器を使ったライブラリ調製などの作業は、利用者と相談の上で当部門担当職員が受託・支援いたし ますので、お気軽にご相談ください。 (担当:小代田、夏井、目黒 内線:6191) ●シングルセル解析 & フローサイトメーターセミナー の資料をダウンロードいただけます(再掲)12月11日と12日の2日間で開催したシングルセル解析 & フローサイトメーターセミナー(オンライン、BD社協力)で使用したスライド資料その他関連資料がダウンロード可能です。下記内容の資料です。シングルセル解析やフロー サイトメーターの使用を検討される方はご覧ください。セミナーの動画をご要望の方はご相談ください。 【オンラインセミナー 1 フローサイトメーター 】 12月11日(水)開催済み 内容:・Melodyを使ったシングルセルソートについて ・Single解析における前処理について ・Melodyができること「アプリケーションノートの紹介」 資料ダウンロードは こちら(学内限定) 【オンラインセミナー 2 シングルセル解析】 12月12日(木)開催済み 内容:・Rhapsodyで可能なシングルセル解析について ・新しく追加されたアプリケーションについて 資料ダウンロードは こちら(学内限定) セミナーの内容に関してご質問などございましたら部門担当までご連絡ください。 (担当:小代田、夏井、目黒 内線:6191) |
【3】分子医学部門だよりの発行とメーリングリスト開設、登録のお願い |
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分子医学部門ではホームページのリニューアルを機に「分子医学部門だより」を発行し、分子医学部門メーリングリストを開設して利用者の皆様に配信を始めました。「分子医学部門だより」では、部門専任教員、職員から分子医学部門の利用についてのお知らせ、各種セミナーや講習会開催のお知らせ、新しい分析機器、分析技術の紹介など、部門ホームページと連携した様々な情報を提供いたします。 メーリングリストへのご登録は部門のホームページ左側、【メール配信 登録ボタン】をクリックし必要事項を記入したメールを送信していただくことで登録できます。 貴部局におかれましては分子医学部門をご利用の教職員、大学院生の方々へメーリングリストへの登録のご案内をよろしくお願いいたします。 |