分子医学部門だより No. 104(2024年11月号)

(2024.11.29 掲載)
 平素より分子医学部門の活動へご理解とご協力をいただき誠にありがとうございます。
 毎号「分子医学部門だより」全文をメールとホームページの両方に掲載しています。利用者の皆様に当部門をより一層
 活用していただく一助となれば幸いです。

目次
【1】部門専任教員から
【2】お知らせ
  ●キコーテック 組織標本の多重染色と染色標本画像解析の技術・実機デモ 追加実施のお知らせ
  ●シングルセル解析 ライブラリ調製作業とデータ解析の受託分析・分析支援サービスのお知らせ
【3】分子医学部門だよりの発行とメーリングリスト開設、登録のお願い

【1】部門専任教員から
日頃より分子医学部門の活動へご理解とご協力をいただき誠にありがとうございます。

今月はキコーテック社の組織標本多重染色セミナーと顕微鏡のデモを行いました。好評をいただきリクエストもあったため追加でデモを行うことにしました。事前に予約をいただければどなたでもお気軽に参加いただけます。詳細はお知らせ欄に記しましたのでご興味ある方は是非ご参加ください。
もう一つのお知らせは、シングルセル解析の支援サービスです。昨今は論文のデータにシングルセル解析を求められることが多くなっています。分子医学部門は利用者がシングルセル解析を特別な準備をしなくても試せるように受託分析・支援サービスを行っていますので是非ご利用ください。今なら学内共通利用のため購入した試薬キットを分割してご利用いただけます。数に限りがありますのでご検討中の方はお早めにご連絡ください。
                                                 (小代田)

【2】お知らせ

キコーテック 組織標本の多重染色と染色標本画像解析の技術・実機デモ 追加実施のお知らせ

先日開催しました下記の実機デモが好評をいただき期間延長のご要望もありましたので、下記日程でデモを追加開催
いたします。ご興味のある方はぜひご参加ください。

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◉追加デモ開催◉
デモ好評につき、下記日程でデモ開催日を追加することになりました。前回都合が合わず参加できなかった方や、
作製中のご自身のサンプルを試しに見てみたい方(2回目、3回目の測定も可能です)など、メーカー担当者が個別
に対応させていただきます。サンプルは用意出来ないがご興味のある方もデモスライドも用意していますので、お
気軽にお申し込みください。

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 【実機デモ】
   期間:12月2日(月)14:00〜 12月4日(水)15:00
     (上記の期間、予約により対応可能。利用者と都合を調整いたします。)
   場所:分子医学部門棟4階 410共通実験室
   内容:Mantra組織定量イメージングシステム(Akoya Bioscience )を用いた蛍光多重染色(Opal)の観察・
      解析、お手持ちの蛍光標本、明視野標本の定量解析
   申込:チラシのデモ内容から希望項目を選択、キコーテック担当者または分子医学部門へお申し込みください。
      実機デモ案内チラシは こちら (学内限定)

      Mantra組織定量イメージングシステムホームページは こちら

 詳細は案内チラシをご覧ください。
 その他、ご不明な点などございましたら担当までご連絡ください。
                                  (担当:小代田、夏井 内線:6191)

シングルセル解析 ライブラリ調製作業とデータ解析の受託分析・分析支援サービスのお知らせ

分子医学部門ではシングルセル解析前処理システムBD Rhapsodyを使用するライブラリ調製作業、および、データ
解析の受託分析・分析支援サービスを行っています。
シングルセル解析を行いたいが試薬や必要な器具を揃えるのに初期費用が高い、サンプル調製方法がわからない、
データ解析の方法がわからない、などの理由で実験に支障を感じている方は是非当部門の受託分析支援サービスを
ご検討ください。

利用の流れ
細胞の用意(利用者)→Rhapsodyを使用したライブラリ調製(部門担当)→シークエンス(利用者、外部受託分析)
→データ解析(部門担当)

 ライブラリ調製作業
    機器:BD Rhapsody シングルセル解析システム (Rhapsody Express, Rhapsody Scanner)
    場所:分子医学部門棟4階 406 シーケンサー室

シングルセル解析を行う際に利用者が負担する初期費用をなるべく抑えるため、4回分の試薬キットを分割して使用
できるように部門で必要な試薬キット、器具類を購入しました。1キットは4回に分けて別々に使用できるので利用
者で日程を合わせる必要はなく、使用した分だけ費用を負担していただく形で利用できます。本機器を使ったライブ
ラリ調製などの作業は、利用者と相談の上で当部門担当職員が受託・支援いたしますので、お気軽にご相談ください。

BD Rhapsodyの導入オンラインセミナーのスライド資料、関連試薬カタログ資料などを部門ホームページにアップ
ロードしましたのでご覧ください。シングルセル解析を実際に行う際の費用例なども記載されていますのでご活用く
ださい。
    Rhapsody 部門ホームページは こちら

 データ解析
シングルセルRNAseqなどの次世代シーケンスデータを解析するための専用のPCとソフトウエアを使い、次世代シー
ケンスデータ解析を支援します。マップ後のデータの他、fastqファイルなど生データを読み込んで解析することも
可能です。公開データベース上のデータを使った解析も可能です。
    解析ソフトウエア:CLC Genomics Workbench (QIAGEN)
    部門ホームページは こちら

データ解析の詳細は部門ホームページをご覧の上、部門担当にご相談ください。

                               (担当:小代田、夏井、目黒 内線:6191)

【3】分子医学部門だよりの発行とメーリングリスト開設、登録のお願い
分子医学部門ではホームページのリニューアルを機に「分子医学部門だより」を発行し、分子医学部門メーリングリストを開設して利用者の皆様に配信を始めました。「分子医学部門だより」では、部門専任教員、職員から分子医学部門の利用についてのお知らせ、各種セミナーや講習会開催のお知らせ、新しい分析機器、分析技術の紹介など、部門ホームページと連携した様々な情報を提供いたします。

メーリングリストへのご登録は部門のホームページ左側、【メール配信 登録ボタン】をクリックし必要事項を記入したメールを送信していただくことで登録できます。
貴部局におかれましては分子医学部門をご利用の教職員、大学院生の方々へメーリングリストへの登録のご案内をよろしくお願いいたします。